Средња школа мртвих смештена је у данашњи Јапан, почевши од планете погођене фаталном пандемијом која људе претвара у зомбије, а еуфемистички се од примарних ликова назива „Њима“ (?? Иатсура?).
Прича прати бројне средњошколце (као и медицинску сестру) док се сналазе користећи светски катастрофални догађај под називом „Избијање“. Такође се морају суочити са даљим ризицима друштвеног пада, врсте опасних преживелих, и потенцијалног пропадања њихових посебних моралних кодекса док глумачка екипа покушава да преживи зомби апокалипсу. Почевши од ХС, ученици беже у град на месту где морају да се носе са његовим ученицима и окаљаним учитељем. Добијају пса као и малу девојчицу и процењују преживеле у својим кућама. После тога коначно се пробијају до основне школе која је наводно сигурна зона, пролазе кроз полицијску станицу и трају у тржном центру.
